马上注册,结交更多好友,享用更多功能,让你轻松玩转社区。
您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?立即注册
x
本帖最后由 青菜567 于 2023-9-28 10:41 编辑
4 z$ B. |! C6 |. p _- b: c, r7 Z* {; q1 z, R7 _- E" e% s, K
无论就医看病还是体检,做的检查除了仪器检查如B超、CT、核磁共振、胃肠镜外,最多的就是生化检查,如基于血液、尿液、大便、痰液等的检测,因为这些体液中含有众多生物标志物,能够提供关于健康状况和疾病风险的重要信息。
6 v5 \* r% x( z/ P , V; x! v/ @3 y! y5 O! v. Q& z& |
以血液为例,血液是流动在人的血管和心脏中的一种红色不透明的粘稠液体,负责各类营养物质的输送以及机体产生的废物的排除。血液由血浆和血细胞组成。血浆中含有水、蛋白质和其他溶解物质,血细胞包括红细胞、白细胞和血小板。 7 a' L# h0 B4 G. A# g' h- t
血液中一些指标的异常时常预示着身体某个器官或组织机能受损。目前基于血液的肿瘤早筛技术中经常提到的cfDNA就是血浆中存在的一种分子标志物。 $ L2 i m$ T) s; }4 I s
(参考于网络图片)* t1 z4 I1 E) H6 V4 u- ]
3 i9 M; N/ f, \; w1 X
如何理解cfDNA和ctDNA? , M& m5 h- f1 k M6 H
cfDNA全称为cell free DNA即细胞游离DNA,顾名思义就是指游离于细胞外的DNA。那么问题来了,DNA不都是在细胞内吗,怎么会跑到细胞外呢?
* d+ T5 F- k+ E9 T0 R+ Q
人体内的细胞不断更新换代,也就是说每天每时每刻我们体内都不断地有细胞在凋亡,又有新的细胞在形成。在细胞凋亡过程中有些DNA会“破壳而出”进入血液中,另外,人体在外界物理或化学刺激下引发的细胞坏死也会导致DNA释放到血液中,所以我们人体血液中都含有cfDNA。 ' J' F9 {0 B- K* a
(参考于网络图片)
) S; S: H+ E C% Q但对于肿瘤患者来说,其血液中除了含有正常细胞凋亡或坏死释放的DNA外,还包括肿瘤细胞释放的DNA,这部分DNA有个专有名称叫ctDNA,全称为circulating tumor DNA即循环肿瘤DNA。因此对于肿瘤患者来说,血液中的cfDNA包含了ctDNA。
" S. s3 ?' h! w( W
ctDNA主要来源于坏死的肿瘤细胞、凋亡的肿瘤细胞、循环肿瘤细胞(CTC)、肿瘤细胞分泌的外排体,其携带与肿瘤发生相关的分子信号,这些分子信号如同肿瘤的“身份指纹”,对肿瘤早筛、肿瘤精准治疗都具有非常重要的意义。 4 c8 F$ C$ v2 m0 J4 X
cfDNA全基因组测序肿瘤早筛技术 $ W2 a, o) h# G; L2 h
通过上面我们了解了cfDNA和ctDNA的概念和区别,那么对于肿瘤早筛来说,到底检测的是cfDNA上的哪些信息?也就是哪些信息是与肿瘤的早期发生相关呢?这个需要经过临床研究进行标志物的筛选和验证。 3 c0 x3 N, {) @1 h: x( [$ b
和瑞基因研发团队通过临床研究发现,仅需受检者10ml静脉血,通过全基因组测序技术(WGS, Whole Genome Sequencing)和自主研发的机器学习算法,在全基因组范围内分析四个维度的特征提取及模型构建,包括末端序列、片段大小分布、核小体印迹、拷贝数变异,可精准评估六大高发高危癌种风险,包括肺癌及五大消化系统癌种(食管癌、胃癌、肝癌、胰腺癌、结直肠癌),并可准确溯源癌症风险器官。
6 u Z ?* r0 @" x6 s* D5 _
那么如何理解四个维度呢? 0 L' c# f' \; |% _4 h$ t6 M2 H
片段大小
- w( D# g( c4 b; Z6 K6 O9 n+ f$ X$ B( s# I. n
DNA片段大小以核苷酸碱基对的数量表示,以bp为单位。肿瘤细胞释放的ctDNA片段大小比正常细胞释放的cfDNA更短。
7 K- @' B/ v6 F 末端序列
3 G* N* p& w# t( K7 x, I( d在DNA片段化进入血液过程中,DNA发生了非随机断裂,其末端的几个核苷酸,癌与非癌具有不同偏好的末端切割模式。
5 o! A8 ~* ~8 P# T ]
) T! {2 `' v! f; i; l3 p 核小体印迹% c h$ e& N! ~, U6 ~8 V$ S
5 [9 ^3 L9 N1 Z5 G- ^, y肿瘤发生和发展的内因是原癌基因的活化和/或抑癌基因的失活等异常表达,而核小体印迹的松散程度可代表基因表达活跃程度的高低。 ) b5 z. V! q/ N0 K. r
拷贝数变异 m4 r: I9 v! j
& b, e `/ `( ?- G. |- r' ^* m
肿瘤组织通常存在拷贝数变异等染色体异常现象,而正常组织基本无此现象。
* {1 S3 L0 U% ^% k+ E( L8 m% x
(可点击图片放大查看) ( M5 E! d1 T0 ~8 U4 R) H" E
! q. f) @1 i8 i! h5 S4 Q, l5 _
|